L’ONEL rend compte à sa tutelle technique, à savoir le MEDD, à son organe délibérant, à savoir le Conseil d’Administration et à sa tutelle financière, le Ministère des Finances.
L’organigramme de l’ONEL est structuré en 5 départements, hiérarchisés en 15 services ancrés dans les départements et 3 services ancrés directement à la Direction Générale. Un conseiller technique et un bureau des antennes.
La structure de l’ONEL, telle qu’adoptée par son Conseil d’Administration, lors de sa session du 8 juillet 2025 et approuvée par Monsieur le Ministre des Finances, en date du 13 août 2025, se compose ainsi qu’il suit :
Département des Ressources DR
Le Département des Ressources DR couvre la gestion des ressources financières, matérielles et humaines de l’Observatoire. Il est structuré en trois (3) services.
Le Service de la Comptabilité
Le Service du Personnel
Le Service des Moyens Généraux
Département de la Publication de la Vulgarisation DPV
Le Service des Synthèses et de la Publication
Le Service du Système d’Information
Le Service de la Communication
Département Terre et Climat DTC
Le Service du Climat et de la Résilience
Le Service de la Biodiversité
Le Service des Pollutions et de la Métrologie
Département du Littoral DL
Le Service du Milieu Cotier
Le Service du Milieu Marin
Le Service de la Socio-Economie
Département des Technologies et de l’Innovation DTI
Le Service de la Cartographie et de la Télédétection
Le Service de l’Innovation et de la Certification
Le Service de la Recherche Opérationnelle
Les autres services
Les trois services ancrés à la Direction Générale sont :
Le Centre de Documentation Électronique
Le Service du Suivi Evaluation
Le Service de la Coopération et du Partenariat
Le Service du Secrétariat Central